Check the newest release v12
Model info
Transcription factorAscl1
ModelASCL1_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length14
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvCAGCTGCYbnbn
Best auROC (human)0.976
Best auROC (mouse)0.993
Peak sets in benchmark (human)30
Peak sets in benchmark (mouse)25
Aligned words342
TF familyMyoD / ASC-related factors {1.2.2}
TF subfamilyAchaete-Scute-like factors {1.2.2.2}
MGIMGI:96919
EntrezGeneGeneID:17172
(SSTAR profile)
UniProt IDASCL1_MOUSE
UniProt ACQ02067
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 3.32061
0.0005 6.21227
0.0001 11.852445
GTEx tissue expression atlas Ascl1 expression
Motifs in JASPAR
MA1100.1 (ASCL1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0123.016.016.01.042.039.017.07.032.051.017.01.09.022.045.03.0
020.0106.00.00.00.0128.00.00.00.095.00.00.00.012.00.00.0
030.00.00.00.0341.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
040.08.0333.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
050.00.00.00.00.08.00.00.00.0333.00.00.00.00.00.00.0
060.00.00.00.00.00.00.0341.00.00.00.00.00.00.00.00.0
070.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0341.00.0
080.00.00.00.00.00.00.00.00.0333.00.08.00.00.00.00.0
090.00.00.00.045.0131.01.0156.00.00.00.00.00.06.00.02.0
101.02.033.09.028.043.09.057.00.01.00.00.010.054.077.017.0
118.09.017.05.026.037.010.027.012.046.043.018.05.026.035.017.0
124.010.023.014.010.035.03.070.016.030.040.019.05.019.019.024.0
138.07.09.011.016.032.016.030.021.026.019.019.015.022.058.032.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.075-0.281-0.281-2.7650.670.597-0.222-1.080.4010.863-0.222-2.765-0.8390.0310.738-1.863
02-4.0861.591-4.086-4.086-4.0861.779-4.086-4.086-4.0861.481-4.086-4.086-4.086-0.561-4.086-4.086
03-4.086-4.086-4.086-4.0862.757-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086
04-4.086-0.9522.733-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086
05-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-0.952-4.086-4.086-4.0862.733-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086
06-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.0862.757-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086
07-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.0862.757-4.086
08-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-4.0862.733-4.086-0.952-4.086-4.086-4.086-4.086
09-4.086-4.086-4.086-4.0860.7381.802-2.7651.976-4.086-4.086-4.086-4.086-4.086-1.226-4.086-2.216
10-2.765-2.2160.431-0.8390.2690.693-0.8390.973-4.086-2.765-4.086-4.086-0.7380.9191.272-0.222
11-0.952-0.839-0.222-1.3960.1960.544-0.7380.233-0.5610.760.693-0.166-1.3960.1960.489-0.222
12-1.603-0.7380.075-0.411-0.7380.489-1.8631.177-0.2810.3370.622-0.113-1.396-0.113-0.1130.117
13-0.952-1.08-0.839-0.646-0.2810.401-0.2810.337-0.0150.196-0.113-0.113-0.3440.0310.990.401