Check the newest release v12
Model info
Transcription factorATF4
(GeneCards)
ModelATF4_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length14
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusdddMTGATGCAAYn
Best auROC (human)0.998
Best auROC (mouse)0.961
Peak sets in benchmark (human)18
Peak sets in benchmark (mouse)9
Aligned words453
TF familyATF-4-related factors {1.1.6}
TF subfamilyATF-4 {1.1.6.0.1}
HGNCHGNC:786
EntrezGeneGeneID:468
(SSTAR profile)
UniProt IDATF4_HUMAN
UniProt ACP18848
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 4.871560000000001
0.0005 7.50681
0.0001 12.843744999999998
GTEx tissue expression atlas ATF4 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ATF4 datasets
Motifs in JASPAR
MA0833.1 (ATF4; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0185.07.074.024.028.03.07.017.032.011.028.08.026.011.065.027.0
0246.027.071.027.09.010.05.08.040.032.078.024.013.07.033.023.0
0353.022.032.01.058.016.02.00.090.074.022.01.034.042.06.00.0
040.04.00.0231.01.00.00.0153.00.00.00.062.00.00.00.02.0
050.01.00.00.00.00.04.00.00.00.00.00.00.04.0441.03.0
060.00.00.00.04.00.00.01.0438.01.04.02.02.00.01.00.0
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080.00.01.00.00.00.016.00.00.00.04.00.00.00.0432.00.0
090.00.00.00.00.00.00.00.037.0377.00.039.00.00.00.00.0
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11448.00.00.00.04.00.00.00.00.00.00.00.00.00.01.00.0
1211.0144.046.0251.00.00.00.00.00.01.00.00.00.00.00.00.0
131.03.05.02.055.036.04.050.023.07.06.010.076.078.049.048.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.09-1.3580.953-0.163-0.011-2.138-1.358-0.5010.121-0.925-0.011-1.231-0.084-0.9250.824-0.047
020.48-0.0470.911-0.047-1.118-1.017-1.674-1.2310.3420.1211.005-0.163-0.763-1.3580.151-0.205
030.621-0.2480.121-3.0330.71-0.561-2.489-4.3181.1470.953-0.248-3.0330.1810.39-1.503-4.318
04-4.318-1.879-4.3182.087-3.033-4.318-4.3181.676-4.318-4.318-4.3180.777-4.318-4.318-4.318-2.489
05-4.318-3.033-4.318-4.318-4.318-4.318-1.879-4.318-4.318-4.318-4.318-4.318-4.318-1.8792.733-2.138
06-4.318-4.318-4.318-4.318-1.879-4.318-4.318-3.0332.726-3.033-1.879-2.489-2.489-4.318-3.033-4.318
07-4.318-0.561-2.4892.699-4.318-4.318-4.318-3.033-3.033-4.318-4.318-1.879-4.318-4.318-2.489-3.033
08-4.318-4.318-3.033-4.318-4.318-4.318-0.561-4.318-4.318-4.318-1.879-4.318-4.318-4.3182.713-4.318
09-4.318-4.318-4.318-4.318-4.318-4.318-4.318-4.3180.2642.577-4.3180.317-4.318-4.318-4.318-4.318
100.237-3.033-4.318-4.3182.574-4.318-4.318-3.033-4.318-4.318-4.318-4.3180.237-2.138-4.318-4.318
112.749-4.318-4.318-4.318-1.879-4.318-4.318-4.318-4.318-4.318-4.318-4.318-4.318-4.318-3.033-4.318
12-0.9251.6160.482.17-4.318-4.318-4.318-4.318-4.318-3.033-4.318-4.318-4.318-4.318-4.318-4.318
13-3.033-2.138-1.674-2.4890.6580.237-1.8790.563-0.205-1.358-1.503-1.0170.9791.0050.5430.522