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Model info
Transcription factorMef2a
ModelMEF2A_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length15
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnddYTATTTWWRRhn
Best auROC (human)0.948
Best auROC (mouse)0.991
Peak sets in benchmark (human)15
Peak sets in benchmark (mouse)6
Aligned words487
TF familyRegulators of differentiation {5.1.1}
TF subfamilyMEF-2 {5.1.1.1}
MGIMGI:99532
EntrezGeneGeneID:17258
(SSTAR profile)
UniProt IDMEF2A_MOUSE
UniProt ACQ60929
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 10.732860000000002
0.0005 12.512060000000002
0.0001 16.18346
GTEx tissue expression atlas Mef2a expression
Motifs in JASPAR
MA0052.1 (MEF2A; Homo sapiens)
MA0052.2 (MEF2A; Homo sapiens)
MA0052.3 (MEF2A; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0143.02.048.036.025.05.06.040.031.013.032.044.039.07.028.088.0
0212.014.079.033.05.01.06.015.012.06.058.038.012.016.089.091.0
032.028.08.03.01.016.01.019.014.0139.019.060.04.0112.09.052.0
040.05.00.016.05.013.00.0277.00.02.00.035.01.015.00.0118.0
056.00.00.00.025.01.01.08.00.00.00.00.0413.02.07.024.0
0630.01.02.0411.01.00.00.02.00.00.01.07.01.00.00.031.0
079.00.01.022.00.00.00.01.00.01.00.02.038.05.03.0405.0
085.00.01.041.01.01.00.04.00.00.00.04.026.017.05.0382.0
096.03.01.022.01.02.01.014.01.01.00.04.089.058.08.0276.0
1011.03.04.079.06.04.00.054.01.01.03.05.035.014.029.0238.0
1129.01.021.02.020.01.00.01.07.01.026.02.0243.02.0127.04.0
1263.016.0187.033.02.00.01.02.016.015.0123.020.05.01.03.00.0
1340.031.04.011.07.011.00.014.0128.095.028.063.018.024.05.08.0
1468.033.047.045.045.046.09.061.011.09.06.011.022.018.014.042.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.342-2.5580.4510.166-0.194-1.744-1.5740.270.018-0.8340.0490.3650.245-1.429-0.0821.053
02-0.912-0.7620.9460.08-1.744-3.101-1.574-0.695-0.912-1.5740.6390.219-0.912-0.6321.0651.087
03-2.558-0.082-1.302-2.208-3.101-0.632-3.101-0.464-0.7621.509-0.4640.672-1.951.294-1.1890.53
04-4.378-1.744-4.378-0.632-1.744-0.834-4.3782.197-4.378-2.558-4.3780.138-3.101-0.695-4.3781.346
05-1.574-4.378-4.378-4.378-0.194-3.101-3.101-1.302-4.378-4.378-4.378-4.3782.596-2.558-1.429-0.234
06-0.014-3.101-2.5582.591-3.101-4.378-4.378-2.558-4.378-4.378-3.101-1.429-3.101-4.378-4.3780.018
07-1.189-4.378-3.101-0.32-4.378-4.378-4.378-3.101-4.378-3.101-4.378-2.5580.219-1.744-2.2082.577
08-1.744-4.378-3.1010.295-3.101-3.101-4.378-1.95-4.378-4.378-4.378-1.95-0.155-0.573-1.7442.518
09-1.574-2.208-3.101-0.32-3.101-2.558-3.101-0.762-3.101-3.101-4.378-1.951.0650.639-1.3022.193
10-0.996-2.208-1.950.946-1.574-1.95-4.3780.568-3.101-3.101-2.208-1.7440.138-0.762-0.0482.046
11-0.048-3.101-0.366-2.558-0.413-3.101-4.378-3.101-1.429-3.101-0.155-2.5582.066-2.5581.419-1.95
120.721-0.6321.8050.08-2.558-4.378-3.101-2.558-0.632-0.6951.387-0.413-1.744-3.101-2.208-4.378
130.270.018-1.95-0.996-1.429-0.996-4.378-0.7621.4271.13-0.0820.721-0.517-0.234-1.744-1.302
140.7970.080.430.3870.3870.409-1.1890.689-0.996-1.189-1.574-0.996-0.32-0.517-0.7620.319