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Model info
Transcription factorNfe2
ModelNFE2_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length17
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusvRTGACTCAGCAndhhn
Best auROC (human)0.904
Best auROC (mouse)0.996
Peak sets in benchmark (human)17
Peak sets in benchmark (mouse)9
Aligned words392
TF familyJun-related factors {1.1.1}
TF subfamilyNF-E2-like factors {1.1.1.2}
MGIMGI:97308
EntrezGeneGeneID:18022
(SSTAR profile)
UniProt IDNFE2_MOUSE
UniProt ACQ07279
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 3.86416
0.0005 6.4584600000000005
0.0001 12.106660000000002
GTEx tissue expression atlas Nfe2 expression
Motifs in JASPAR
MA0501.1 (MAF::NFE2; Homo sapiens)
MA0841.1 (NFE2; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0157.00.036.01.094.04.04.00.0110.05.033.00.015.04.020.00.0
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030.00.01.00.00.00.00.00.01.00.00.00.00.00.0380.01.0
041.00.00.00.00.00.00.00.0381.00.00.00.01.00.00.00.0
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060.00.01.013.019.07.06.0269.00.01.00.057.01.01.02.06.0
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100.03.00.00.00.02.00.00.01.0368.03.02.01.02.00.01.0
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1463.011.013.027.017.06.01.017.031.05.03.018.015.019.07.0130.0
1554.020.028.024.014.010.01.016.06.05.04.09.058.040.015.079.0
1670.018.024.020.018.020.03.034.011.012.012.013.020.040.020.048.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.859-4.180.403-2.8751.356-1.716-1.716-4.181.513-1.510.317-4.18-0.458-1.716-0.177-4.18
02-2.875-4.18-2.8752.424-4.18-4.18-4.18-0.598-4.18-4.18-4.181.346-4.18-4.18-4.18-2.875
03-4.18-4.18-2.875-4.18-4.18-4.18-4.18-4.18-2.875-4.18-4.18-4.18-4.18-4.182.75-2.875
04-2.875-4.18-4.18-4.18-4.18-4.18-4.18-4.182.753-4.18-4.18-4.18-2.875-4.18-4.18-4.18
05-0.5262.5170.876-0.852-4.18-4.18-4.18-4.18-4.18-4.18-4.18-4.18-4.18-4.18-4.18-4.18
06-4.18-4.18-2.875-0.598-0.227-1.193-1.3392.405-4.18-2.875-4.180.859-2.875-2.875-2.327-1.339
07-1.716-0.598-2.327-2.875-2.875-1.339-2.875-2.875-4.18-1.193-2.327-4.18-0.3952.527-0.675-0.598
08-0.458-4.18-1.339-4.182.569-2.875-1.193-1.51-2.875-4.18-0.76-1.51-1.716-4.18-0.852-2.875
09-4.18-2.3272.615-1.975-4.18-4.18-2.875-4.18-1.975-4.180.223-2.875-4.18-4.18-0.76-4.18
10-4.18-1.975-4.18-4.18-4.18-2.327-4.18-4.18-2.8752.718-1.975-2.327-2.875-2.327-4.18-2.875
11-2.327-4.18-4.18-4.182.642-1.51-0.28-0.76-2.875-2.875-2.875-4.18-4.18-2.327-2.875-4.18
121.1960.9741.7610.893-1.51-2.327-4.18-2.875-1.975-1.339-1.51-1.339-1.975-2.875-1.51-2.327
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