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Model info
Transcription factorPOU3F2
(GeneCards)
ModelPO3F2_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length20
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnbdSMTGMATWWKbMWddvn
Best auROC (human)0.813
Best auROC (mouse)0.945
Peak sets in benchmark (human)12
Peak sets in benchmark (mouse)22
Aligned words330
TF familyPOU domain factors {3.1.10}
TF subfamilyPOU3 (Oct-6-like factors) {3.1.10.3}
HGNCHGNC:9215
EntrezGeneGeneID:5454
(SSTAR profile)
UniProt IDPO3F2_HUMAN
UniProt ACP20265
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 8.70831
0.0005 10.66611
0.0001 14.77326
GTEx tissue expression atlas POU3F2 expression
ReMap ChIP-seq dataset list POU3F2 datasets
Motifs in JASPAR
MA0787.1 (POU3F2; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0118.036.028.08.015.044.06.015.06.036.029.020.04.026.027.07.0
026.02.017.018.048.05.04.085.025.014.023.028.06.01.017.026.0
037.045.025.08.02.014.03.03.09.040.03.09.011.095.034.017.0
0421.02.06.00.0164.024.02.04.028.017.06.014.029.04.03.01.0
050.00.012.0230.03.01.00.043.01.00.00.016.05.01.00.013.0
060.01.08.00.01.00.01.00.05.00.06.01.04.01.0296.01.0
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104.00.00.02.07.02.00.03.019.08.02.02.0212.011.013.040.0
11102.011.02.0127.09.04.00.08.08.04.01.02.035.06.05.01.0
1216.02.015.0121.05.03.02.015.00.01.03.04.03.08.087.040.0
137.08.04.05.03.04.07.00.01.062.013.031.00.030.0102.048.0
141.09.00.01.093.08.01.02.025.073.017.011.030.048.04.02.0
1526.08.09.0106.0126.04.00.08.019.01.00.02.012.01.01.02.0
1611.025.028.0119.07.02.00.05.02.01.03.04.017.06.076.019.0
1711.04.016.06.026.00.04.04.061.08.017.021.036.09.073.029.0
1824.022.078.010.08.03.07.03.036.014.050.010.014.06.030.010.0
1925.013.034.010.014.07.010.014.044.032.052.037.02.023.02.06.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.1190.5650.316-0.905-0.2970.763-1.179-0.297-1.1790.5650.351-0.015-1.5560.2430.28-1.033
02-1.179-2.17-0.175-0.1190.85-1.35-1.5561.4180.204-0.3640.1220.316-1.179-2.72-0.1750.243
03-1.0330.7860.204-0.905-2.17-0.364-1.816-1.816-0.7920.669-1.816-0.792-0.5991.5290.508-0.175
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06-4.046-2.72-0.905-4.046-2.72-4.046-2.72-4.046-1.35-4.046-1.179-2.72-1.556-2.722.663-2.72
07-1.816-1.816-1.556-4.046-4.046-2.72-2.72-4.0462.2251.71-1.179-4.046-2.72-4.046-4.046-2.72
082.204-1.816-1.35-4.0461.638-1.556-2.72-1.033-1.556-2.17-1.556-2.72-2.72-4.046-4.046-4.046
09-1.556-1.0330.1642.545-4.046-2.72-2.72-1.033-2.72-2.72-1.35-1.816-2.72-1.816-2.72-1.816
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13-1.033-0.905-1.556-1.35-1.816-1.556-1.033-4.046-2.721.104-0.4360.417-4.0460.3841.60.85
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