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Model info
Transcription factorPOU5F1
(GeneCards)
ModelPO5F1_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length18
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnbYWTTSWhATGYARRhn
Best auROC (human)0.986
Best auROC (mouse)0.985
Peak sets in benchmark (human)44
Peak sets in benchmark (mouse)119
Aligned words501
TF familyPOU domain factors {3.1.10}
TF subfamilyPOU5 (Oct-3/4-like factors) {3.1.10.5}
HGNCHGNC:9221
EntrezGeneGeneID:5460
(SSTAR profile)
UniProt IDPO5F1_HUMAN
UniProt ACQ01860
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.11471
0.0005 11.283760000000001
0.0001 15.82891
GTEx tissue expression atlas POU5F1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list POU5F1 datasets
Motifs in JASPAR
MA0142.1 (Pou5f1::Sox2; Mus musculus)
MA1115.1 (POU5F1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
015.031.029.015.017.057.07.041.00.069.036.038.010.076.027.038.0
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0314.01.02.014.0124.012.02.0139.018.01.03.014.047.03.04.098.0
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110.00.03.00.00.00.00.01.00.00.00.00.01.00.0453.038.0
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1662.038.049.0247.011.03.01.09.017.015.07.09.01.06.04.017.0
1725.014.022.030.023.020.07.012.017.018.012.014.049.030.0111.092.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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04-2.226-2.226-1.5921.808-2.576-3.119-4.393-0.78-3.119-3.119-2.226-1.592-1.592-1.762-1.1062.052
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10-2.576-3.119-4.3932.707-4.393-4.393-4.393-2.576-3.119-4.393-4.393-1.32-4.393-4.393-4.393-0.93
11-4.393-4.393-2.226-4.393-4.393-4.393-4.393-3.119-4.393-4.393-4.393-4.393-3.119-4.3932.670.201
12-4.393-3.119-4.393-4.393-4.393-4.393-4.393-4.393-1.5922.360.4330.808-2.5760.0-3.119-1.762
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152.092-1.968-0.431-1.106-0.174-2.576-4.393-2.5761.112-1.447-0.93-1.592-0.384-1.014-0.65-1.106
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