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Model info
Transcription factorRunx3
ModelRUNX3_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length15
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusbnhTGTGGTbdnbvn
Best auROC (human)0.994
Best auROC (mouse)0.979
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)27
Aligned words198
TF familyRunt-related factors {6.4.1}
TF subfamilyRunx3 (PEBP2alphaC, CBF-alpha3, AML-2) {6.4.1.0.3}
MGIMGI:102672
EntrezGene
UniProt IDRUNX3_MOUSE
UniProt ACQ64131
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.87856
0.0005 10.19961
0.0001 15.047509999999999
GTEx tissue expression atlas Runx3 expression
Motifs in JASPAR
MA0684.1 (RUNX3; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.06.012.01.010.08.06.017.06.016.031.025.08.014.015.09.0
023.013.01.07.07.028.02.07.020.038.04.02.03.025.05.019.0
035.00.00.028.02.00.00.0102.01.00.00.011.03.01.00.031.0
040.00.011.00.00.00.01.00.00.00.00.00.03.00.0168.01.0
050.01.00.02.00.00.00.00.08.07.01.0164.00.00.00.01.0
060.00.08.00.00.00.08.00.00.00.01.00.00.01.0166.00.0
070.00.00.00.00.00.01.00.00.01.0182.00.00.00.00.00.0
080.00.00.00.00.00.00.01.00.02.08.0173.00.00.00.00.0
090.00.00.00.00.01.00.01.00.03.00.05.012.060.017.085.0
108.01.00.03.026.00.01.037.010.00.04.03.028.04.023.036.0
1117.018.029.08.01.01.01.02.05.06.05.012.09.013.032.025.0
127.010.014.01.06.018.04.010.010.026.016.015.00.07.030.010.0
132.09.010.02.019.026.04.012.015.018.023.08.00.07.025.04.0
143.09.014.010.019.014.07.020.02.012.028.020.01.08.015.02.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-3.591-0.6260.041-2.188-0.136-0.351-0.6260.382-0.6260.3220.9740.762-0.3510.1920.259-0.237
02-1.2690.119-2.188-0.479-0.4790.873-1.626-0.4790.5421.176-1.006-1.626-1.2690.762-0.7980.491
03-0.798-3.591-3.5910.873-1.626-3.591-3.5912.158-2.188-3.591-3.591-0.043-1.269-2.188-3.5910.974
04-3.591-3.591-0.043-3.591-3.591-3.591-2.188-3.591-3.591-3.591-3.591-3.591-1.269-3.5912.656-2.188
05-3.591-2.188-3.591-1.626-3.591-3.591-3.591-3.591-0.351-0.479-2.1882.632-3.591-3.591-3.591-2.188
06-3.591-3.591-0.351-3.591-3.591-3.591-0.351-3.591-3.591-3.591-2.188-3.591-3.591-2.1882.644-3.591
07-3.591-3.591-3.591-3.591-3.591-3.591-2.188-3.591-3.591-2.1882.736-3.591-3.591-3.591-3.591-3.591
08-3.591-3.591-3.591-3.591-3.591-3.591-3.591-2.188-3.591-1.626-0.3512.685-3.591-3.591-3.591-3.591
09-3.591-3.591-3.591-3.591-3.591-2.188-3.591-2.188-3.591-1.269-3.591-0.7980.0411.6290.3821.976
10-0.351-2.188-3.591-1.2690.8-3.591-2.1881.149-0.136-3.591-1.006-1.2690.873-1.0060.6791.122
110.3820.4380.908-0.351-2.188-2.188-2.188-1.626-0.798-0.626-0.7980.041-0.2370.1191.0060.762
12-0.479-0.1360.192-2.188-0.6260.438-1.006-0.136-0.1360.80.3220.259-3.591-0.4790.942-0.136
13-1.626-0.237-0.136-1.6260.4910.8-1.0060.0410.2590.4380.679-0.351-3.591-0.4790.762-1.006
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