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Model info
Transcription factorSPIB
(GeneCards)
ModelSPIB_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length19
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusvvRRWRRGGAASTGRdRvn
Best auROC (human)0.999
Best auROC (mouse)0.961
Peak sets in benchmark (human)12
Peak sets in benchmark (mouse)3
Aligned words413
TF familyEts-related factors {3.5.2}
TF subfamilySpi-like factors {3.5.2.5}
HGNCHGNC:11242
EntrezGeneGeneID:6689
(SSTAR profile)
UniProt IDSPIB_HUMAN
UniProt ACQ01892
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 6.615710000000001
0.0005 9.01806
0.0001 14.15251
GTEx tissue expression atlas SPIB expression
ReMap ChIP-seq dataset list SPIB datasets
Motifs in JASPAR
MA0081.1 (SPIB; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0161.015.070.016.054.013.04.012.056.014.039.06.015.06.024.07.0
02145.00.029.012.033.07.02.06.0104.07.014.012.014.03.012.012.0
03247.06.037.06.09.03.01.04.026.07.024.00.011.02.012.017.0
04223.08.022.040.015.01.00.02.039.09.019.07.01.02.03.021.0
0546.012.0218.02.016.03.01.00.010.02.030.02.07.02.060.01.0
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082.01.033.00.00.00.00.00.06.01.0367.01.00.00.01.00.0
096.01.01.00.02.00.00.00.0392.08.01.00.00.00.01.00.0
10392.01.03.04.07.00.01.01.03.00.00.00.00.00.00.00.0
1118.080.0300.04.00.01.00.00.00.02.02.00.00.01.04.00.0
123.01.00.014.010.01.00.073.07.07.02.0290.01.01.01.01.0
132.00.019.00.01.00.09.00.00.00.03.00.02.07.0367.02.0
143.00.02.00.02.01.02.02.0263.030.089.016.00.00.02.00.0
15175.015.070.08.012.03.04.012.016.016.041.022.01.05.09.03.0
16160.010.018.016.015.06.01.017.069.015.025.015.08.010.018.09.0
1740.092.0101.019.013.014.04.010.09.021.022.010.05.015.024.013.0
1818.013.027.09.028.056.09.049.034.042.032.043.011.09.014.018.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.854-0.530.991-0.4670.733-0.669-1.787-0.7470.769-0.5970.41-1.41-0.53-1.41-0.069-1.265
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032.248-1.410.358-1.41-1.025-2.046-2.944-1.7870.01-1.265-0.069-4.24-0.831-2.397-0.747-0.408
042.146-1.138-0.1550.435-0.53-2.944-4.24-2.3970.41-1.025-0.299-1.265-2.944-2.397-2.046-0.201
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060.303-4.240.507-2.944-0.747-2.944-1.41-4.242.0760.011.033-2.397-2.397-4.24-2.397-2.944
07-0.831-4.242.244-4.24-0.747-4.24-0.597-2.944-0.747-4.241.459-4.24-2.944-4.24-2.046-4.24
08-2.397-2.9440.245-4.24-4.24-4.24-4.24-4.24-1.41-2.9442.643-2.944-4.24-4.24-2.944-4.24
09-1.41-2.944-2.944-4.24-2.397-4.24-4.24-4.242.709-1.138-2.944-4.24-4.24-4.24-2.944-4.24
102.709-2.944-2.046-1.787-1.265-4.24-2.944-2.944-2.046-4.24-4.24-4.24-4.24-4.24-4.24-4.24
11-0.3521.1242.442-1.787-4.24-2.944-4.24-4.24-4.24-2.397-2.397-4.24-4.24-2.944-1.787-4.24
12-2.046-2.944-4.24-0.597-0.923-2.944-4.241.033-1.265-1.265-2.3972.408-2.944-2.944-2.944-2.944
13-2.397-4.24-0.299-4.24-2.944-4.24-1.025-4.24-4.24-4.24-2.046-4.24-2.397-1.2652.643-2.397
14-2.046-4.24-2.397-4.24-2.397-2.944-2.397-2.3972.3110.1511.23-0.467-4.24-4.24-2.397-4.24
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18-0.352-0.6690.047-1.0250.0830.769-1.0250.6370.2740.4840.2140.507-0.831-1.025-0.597-0.352