Check the newest release v12
Model info
Transcription factorSTAT5B
(GeneCards)
ModelSTA5B_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length12
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusdhTTCYTRGAAn
Best auROC (human)0.963
Best auROC (mouse)0.963
Peak sets in benchmark (human)16
Peak sets in benchmark (mouse)31
Aligned words508
TF familySTAT factors {6.2.1}
TF subfamilySTAT5B {6.2.1.0.6}
HGNCHGNC:11367
EntrezGeneGeneID:6777
(SSTAR profile)
UniProt IDSTA5B_HUMAN
UniProt ACP51692
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.666575
0.0005 11.8248
0.0001 17.047829999999998
GTEx tissue expression atlas STAT5B expression
ReMap ChIP-seq dataset list STAT5B datasets
Motifs in JASPAR
MA0519.1 (Stat5a::Stat5b; Mus musculus)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0132.038.039.076.09.013.04.040.040.028.019.036.014.019.027.066.0
021.01.01.092.01.00.01.096.00.04.01.084.03.01.03.0211.0
031.00.00.04.00.00.00.06.02.00.00.04.042.09.02.0430.0
041.043.01.00.00.08.00.01.01.01.00.00.013.0428.03.00.0
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060.024.00.016.00.040.00.098.00.06.00.02.00.0172.00.0142.0
070.00.00.00.0174.06.025.037.00.00.00.00.0113.00.0123.022.0
080.00.0284.03.00.00.06.00.00.00.0140.08.00.00.059.00.0
090.00.00.00.00.00.00.00.0426.01.05.057.08.00.00.03.0
10412.05.014.03.01.00.00.00.04.01.00.00.057.00.03.00.0
11179.076.096.0123.01.00.03.02.03.05.03.06.00.01.02.00.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.0230.1930.2190.881-1.215-0.86-1.9750.2440.244-0.108-0.490.14-0.788-0.49-0.1440.741
02-3.126-3.126-3.1261.072-3.126-4.4-3.1261.114-4.4-1.975-3.1260.981-2.234-3.126-2.2341.899
03-3.126-4.4-4.4-1.975-4.4-4.4-4.4-1.6-2.584-4.4-4.4-1.9750.293-1.215-2.5842.61
04-3.1260.316-3.126-4.4-4.4-1.328-4.4-3.126-3.126-3.126-4.4-4.4-0.862.606-2.234-4.4
05-3.126-1.328-3.126-1.770.2191.393-1.4542.274-4.4-2.584-4.4-2.584-4.4-3.126-4.4-4.4
06-4.4-0.26-4.4-0.658-4.40.244-4.41.135-4.4-1.6-4.4-2.584-4.41.695-4.41.504
07-4.4-4.4-4.4-4.41.707-1.6-0.220.167-4.4-4.4-4.4-4.41.276-4.41.361-0.346
08-4.4-4.42.196-2.234-4.4-4.4-1.6-4.4-4.4-4.41.49-1.328-4.4-4.40.63-4.4
09-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.42.601-3.126-1.770.595-1.328-4.4-4.4-2.234
102.568-1.77-0.788-2.234-3.126-4.4-4.4-4.4-1.975-3.126-4.4-4.40.595-4.4-2.234-4.4
111.7350.8811.1141.361-3.126-4.4-2.234-2.584-2.234-1.77-2.234-1.6-4.4-3.126-2.584-4.4