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Model info
Transcription factorStat2
ModelSTAT2_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length21
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvvRRAAhnGAAASYRRRdnn
Best auROC (human)0.981
Best auROC (mouse)0.994
Peak sets in benchmark (human)11
Peak sets in benchmark (mouse)8
Aligned words509
TF familySTAT factors {6.2.1}
TF subfamilySTAT2 {6.2.1.0.2}
MGIMGI:103039
EntrezGene
UniProt IDSTAT2_MOUSE
UniProt ACQ9WVL2
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.73071
0.0005 10.19061
0.0001 15.35841
GTEx tissue expression atlas Stat2 expression
Motifs in JASPAR
MA0517.1 (STAT1::STAT2; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0146.024.059.017.058.019.010.026.023.014.055.09.040.015.061.016.0
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141.03.03.018.040.053.01.0239.016.025.09.079.00.02.00.03.0
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1658.07.026.011.020.01.00.08.0227.014.024.019.057.01.08.011.0
17265.019.045.033.09.02.01.011.038.09.09.02.012.013.018.06.0
18240.027.039.018.013.08.03.019.032.06.015.020.011.010.023.08.0
1951.0122.0105.018.014.012.04.021.030.020.018.012.011.014.022.018.0
2026.022.029.029.042.055.08.063.046.033.018.052.013.024.019.013.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.399-0.2440.646-0.5830.629-0.474-1.098-0.166-0.286-0.7720.576-1.1990.26-0.7050.679-0.642
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072.0680.5390.2851.344-1.199-4.387-4.387-2.568-1.754-1.96-4.387-1.584-2.568-3.111-2.218-3.111
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100.235-2.218-1.584-4.387-2.218-4.387-4.387-4.3872.629-1.96-3.111-2.218-2.568-4.387-4.387-4.387
112.717-4.387-1.96-4.387-1.439-4.387-4.387-4.387-1.584-4.387-3.111-4.387-2.218-4.387-4.387-4.387
122.738-2.568-3.111-2.218-4.387-4.387-4.387-4.387-1.754-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387
13-0.2442.3591.417-1.754-3.111-3.111-4.387-4.387-4.387-3.111-4.387-4.387-4.387-2.568-3.111-4.387
14-3.111-2.218-2.218-0.5270.260.539-3.1112.04-0.642-0.204-1.1990.936-4.387-2.568-4.387-2.218
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