Check the newest release v12
Model info
Transcription factorTFE3
(GeneCards)
ModelTFE3_HUMAN.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length12
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusndGTCAYGTGAb
Best auROC (human)0.503
Best auROC (mouse)1.0
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)30
Aligned words437
TF familybHLH-ZIP factors {1.2.6}
TF subfamilyTFE3-like factors {1.2.6.1}
HGNCHGNC:11752
EntrezGeneGeneID:7030
(SSTAR profile)
UniProt IDTFE3_HUMAN
UniProt ACP19532
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 5.90812
0.0005 8.042575
0.0001 12.45884
GTEx tissue expression atlas TFE3 expression
ReMap ChIP-seq dataset list TFE3 datasets
Motifs in JASPAR
MA0831.1 (TFE3; Homo sapiens)
MA0831.2 (TFE3; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0144.00.060.010.025.014.026.020.038.02.066.022.022.00.049.07.0
029.02.0117.01.06.00.010.00.042.05.0152.02.04.00.055.00.0
034.03.010.044.03.00.00.04.010.013.030.0281.01.00.01.01.0
040.018.00.00.00.016.00.00.00.041.00.00.00.0329.00.01.0
050.00.00.00.0382.02.01.019.00.00.00.00.00.01.00.00.0
060.0268.012.0102.00.01.00.02.00.00.00.01.00.012.02.05.0
070.00.00.00.018.06.0256.01.00.05.08.01.04.01.0105.00.0
081.02.01.018.00.01.00.011.011.05.011.0342.00.00.00.02.0
090.01.011.00.00.00.07.01.00.00.012.00.01.00.0371.01.0
100.01.00.00.00.01.00.00.0322.031.039.09.02.00.00.00.0
114.0155.044.0121.08.04.06.015.07.08.014.010.00.03.05.01.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.547-4.2260.855-0.907-0.012-0.5810.026-0.2320.401-2.3810.949-0.138-0.138-4.2260.653-1.248
02-1.008-2.3811.519-2.927-1.394-4.226-0.907-4.2260.501-1.5641.78-2.381-1.77-4.2260.768-4.226
03-1.77-2.03-0.9070.547-2.03-4.226-4.226-1.77-0.907-0.6530.1682.394-2.927-4.226-2.927-2.927
04-4.226-0.335-4.226-4.226-4.226-0.45-4.226-4.226-4.2260.477-4.226-4.226-4.2262.551-4.226-2.927
05-4.226-4.226-4.226-4.2262.7-2.381-2.927-0.282-4.226-4.226-4.226-4.226-4.226-2.927-4.226-4.226
06-4.2262.346-0.731.383-4.226-2.927-4.226-2.381-4.226-4.226-4.226-2.927-4.226-0.73-2.381-1.564
07-4.226-4.226-4.226-4.226-0.335-1.3942.301-2.927-4.226-1.564-1.121-2.927-1.77-2.9271.412-4.226
08-2.927-2.381-2.927-0.335-4.226-2.927-4.226-0.815-0.815-1.564-0.8152.59-4.226-4.226-4.226-2.381
09-4.226-2.927-0.815-4.226-4.226-4.226-1.248-2.927-4.226-4.226-0.73-4.226-2.927-4.2262.671-2.927
10-4.226-2.927-4.226-4.226-4.226-2.927-4.226-4.2262.530.20.427-1.008-2.381-4.226-4.226-4.226
11-1.771.80.5471.553-1.121-1.77-1.394-0.513-1.248-1.121-0.581-0.907-4.226-2.03-1.564-2.927