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Model info
Transcription factorTWIST1
(GeneCards)
ModelTWST1_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length20
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvCAKCTGKhhbbvAKhWdn
Best auROC (human)0.997
Best auROC (mouse)0.568
Peak sets in benchmark (human)9
Peak sets in benchmark (mouse)8
Aligned words225
TF familyTal-related factors {1.2.3}
TF subfamilyTwist-like factors {1.2.3.2}
HGNCHGNC:12428
EntrezGeneGeneID:7291
(SSTAR profile)
UniProt IDTWST1_HUMAN
UniProt ACQ15672
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
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0.0001 14.257660000000001
GTEx tissue expression atlas TWIST1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list TWIST1 datasets
Motifs in JASPAR
MA1123.1 (TWIST1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0137.014.017.01.036.012.09.03.028.014.014.02.08.011.017.02.0
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PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.953-0.0040.186-2.3760.926-0.155-0.433-1.4620.677-0.004-0.004-1.818-0.546-0.2390.186-1.818
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