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Model info
Transcription factorCTCFL
(GeneCards)
ModelCTCFL_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length18
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusvSCdShAGGKGGCGShnn
Best auROC (human)0.98
Best auROC (mouse)0.995
Peak sets in benchmark (human)25
Peak sets in benchmark (mouse)8
Aligned words490
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyCTCF-like factors {2.3.3.50}
HGNCHGNC:16234
EntrezGeneGeneID:140690
(SSTAR profile)
UniProt IDCTCFL_HUMAN
UniProt ACQ8NI51
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 2.2046099999999997
0.0005 4.573309999999999
0.0001 9.62221
GTEx tissue expression atlas CTCFL expression
ReMap ChIP-seq dataset list CTCFL datasets
Motifs in JASPAR
MA1102.1 (CTCFL; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
019.068.011.06.04.066.015.06.015.0167.017.010.01.079.010.01.0
022.026.00.01.09.0366.02.03.02.041.07.03.01.021.01.00.0
035.00.08.01.0176.039.0140.099.03.03.04.00.00.03.03.01.0
0413.090.080.01.08.019.016.02.017.097.039.02.06.031.064.00.0
055.024.08.07.034.0107.013.083.027.0117.08.047.01.01.03.00.0
0649.06.07.05.0235.03.00.011.020.07.01.04.0122.02.08.05.0
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080.00.03.00.00.01.00.01.0103.03.0369.03.01.00.01.00.0
091.04.096.03.01.02.01.00.033.024.0272.044.00.01.03.00.0
101.01.033.00.02.00.029.00.02.03.0365.02.00.00.047.00.0
110.00.05.00.00.01.01.02.03.06.0447.018.00.00.02.00.0
120.03.00.00.00.07.00.00.042.0398.04.011.01.018.00.01.0
132.01.040.00.0109.02.0308.07.00.00.04.00.01.01.010.00.0
141.022.086.03.03.01.00.00.017.0301.027.017.01.06.00.00.0
150.010.03.09.024.0126.026.0154.021.048.07.037.04.07.03.06.0
164.017.019.09.091.056.025.019.02.021.014.02.037.040.0120.09.0
1721.041.055.017.016.016.040.062.020.074.031.053.03.010.016.010.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-1.1850.801-0.992-1.57-1.9460.771-0.691-1.57-0.6911.696-0.569-1.084-3.0970.95-1.084-3.097
02-2.554-0.151-4.375-3.097-1.1852.479-2.554-2.204-2.5540.299-1.425-2.204-3.097-0.361-3.097-4.375
03-1.74-4.375-1.298-3.0971.7480.2491.521.175-2.204-2.204-1.946-4.375-4.375-2.204-2.204-3.097
04-0.831.080.963-3.097-1.298-0.46-0.628-2.554-0.5691.1540.249-2.554-1.570.0220.741-4.375
05-1.74-0.23-1.298-1.4250.1131.252-0.830.999-0.1141.341-1.2980.434-3.097-3.097-2.204-4.375
060.475-1.57-1.425-1.742.037-2.204-4.375-0.992-0.409-1.425-3.097-1.9461.383-2.554-1.298-1.74
07-2.204-4.3752.619-2.554-4.375-4.375-0.513-4.375-4.375-2.554-0.758-4.375-4.375-4.375-0.19-4.375
08-4.375-4.375-2.204-4.375-4.375-3.097-4.375-3.0971.214-2.2042.488-2.204-3.097-4.375-3.097-4.375
09-3.097-1.9461.144-2.204-3.097-2.554-3.097-4.3750.084-0.232.1830.369-4.375-3.097-2.204-4.375
10-3.097-3.0970.084-4.375-2.554-4.375-0.044-4.375-2.554-2.2042.477-2.554-4.375-4.3750.434-4.375
11-4.375-4.375-1.74-4.375-4.375-3.097-3.097-2.554-2.204-1.572.679-0.513-4.375-4.375-2.554-4.375
12-4.375-2.204-4.375-4.375-4.375-1.425-4.375-4.3750.3232.563-1.946-0.992-3.097-0.513-4.375-3.097
13-2.554-3.0970.274-4.3751.271-2.5542.307-1.425-4.375-4.375-1.946-4.375-3.097-3.097-1.084-4.375
14-3.097-0.3161.035-2.204-2.204-3.097-4.375-4.375-0.5692.284-0.114-0.569-3.097-1.57-4.375-4.375
15-4.375-1.084-2.204-1.185-0.231.415-0.1511.615-0.3610.455-1.4250.197-1.946-1.425-2.204-1.57
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17-0.3610.2990.59-0.569-0.628-0.6280.2740.709-0.4090.8850.0220.553-2.204-1.084-0.628-1.084