Model info
Transcription factorDmrtb1
ModelDMRTB_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length18
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnbdGhWACATTGTWdChn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.9
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)3
Aligned words460
TF familyDMRT {2.5.1}
TF subfamilyDMRTB1 {2.5.1.0.6}
MGIMGI:1927125
EntrezGeneGeneID:56296
(SSTAR profile)
UniProt IDDMRTB_MOUSE
UniProt ACA2A9I7
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.58276
0.0005 9.73816
0.0001 14.33576
GTEx tissue expression atlas Dmrtb1 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0117.028.041.037.012.025.06.065.011.018.015.030.08.025.036.042.0
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032.01.075.02.02.03.019.02.09.00.0113.06.02.07.0167.06.0
0411.02.00.02.01.08.00.02.0124.0153.08.089.03.04.02.07.0
0525.018.02.094.053.014.01.099.06.02.02.00.019.07.00.074.0
06100.01.00.02.037.01.03.00.04.00.00.01.0256.01.00.010.0
071.0386.04.06.00.03.00.00.00.03.00.00.01.09.00.03.0
081.00.00.01.0296.05.03.097.00.00.00.04.02.01.00.06.0
090.00.073.0226.00.00.01.05.00.00.00.03.00.00.021.087.0
100.00.00.00.00.00.00.00.012.02.01.080.043.03.04.0271.0
117.03.044.01.00.02.02.01.00.01.04.00.03.07.0326.015.0
122.00.00.08.03.00.01.09.02.03.03.0368.02.02.02.011.0
136.01.00.02.04.00.00.01.01.02.00.03.0226.018.030.0122.0
1464.08.067.098.03.03.03.012.03.07.06.014.032.03.053.040.0
157.083.05.07.09.010.00.02.08.0117.02.02.011.0145.01.07.0
1610.014.04.07.0127.0120.021.087.04.02.01.01.04.07.01.06.0
1750.031.046.018.074.026.05.038.09.08.06.04.017.024.034.026.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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03-2.407-2.9531.05-2.407-2.407-2.056-0.308-2.407-1.034-4.2481.458-1.42-2.407-1.2741.848-1.42
04-0.841-2.407-4.248-2.407-2.953-1.147-4.248-2.4071.5511.76-1.1471.22-2.056-1.796-2.407-1.274
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07-2.9532.684-1.796-1.42-4.248-2.056-4.248-4.248-4.248-2.056-4.248-4.248-2.953-1.034-4.248-2.056
08-2.953-4.248-4.248-2.9532.419-1.59-2.0561.306-4.248-4.248-4.248-1.796-2.407-2.953-4.248-1.42
09-4.248-4.2481.0232.15-4.248-4.248-2.953-1.59-4.248-4.248-4.248-2.056-4.248-4.248-0.211.198
10-4.248-4.248-4.248-4.248-4.248-4.248-4.248-4.248-0.757-2.407-2.9531.1140.497-2.056-1.7962.331
11-1.274-2.0560.52-2.953-4.248-2.407-2.407-2.953-4.248-2.953-1.796-4.248-2.056-1.2742.516-0.54
12-2.407-4.248-4.248-1.147-2.056-4.248-2.953-1.034-2.407-2.056-2.0562.637-2.407-2.407-2.407-0.841
13-1.42-2.953-4.248-2.407-1.796-4.248-4.248-2.953-2.953-2.407-4.248-2.0562.15-0.3610.1411.535
140.892-1.1470.9381.316-2.056-2.056-2.056-0.757-2.056-1.274-1.42-0.6070.205-2.0560.7050.426
15-1.2741.151-1.59-1.274-1.034-0.933-4.248-2.407-1.1471.493-2.407-2.407-0.8411.707-2.953-1.274
16-0.933-0.607-1.796-1.2741.5751.518-0.211.198-1.796-2.407-2.953-2.953-1.796-1.274-2.953-1.42
170.6470.1740.564-0.3611.0370.0-1.590.375-1.034-1.147-1.42-1.796-0.417-0.0790.2650.0