Model info
Transcription factorFoxa3
ModelFOXA3_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length16
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnbbhTGTTTACWYWdn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.9933742514635158
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)6
Aligned words515
TF familyForkhead box (FOX) factors{3.3.1}
TF subfamilyFOXA{3.3.1.1}
MGI1347477
EntrezGene15377
UniProt IDFOXA3_MOUSE
UniProt ACP35584
Comment
Downloads pcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.38101
0.0005 11.47921
0.0001 15.881260000000001
GTEx tissue expression atlas Foxa3 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0113.021.024.018.017.054.06.036.013.076.030.043.09.066.032.039.0
028.022.018.04.058.094.08.057.02.049.030.011.07.063.043.023.0
0338.019.012.06.057.024.04.0143.012.040.012.035.09.027.09.050.0
042.00.03.0111.02.00.00.0108.00.00.00.037.01.00.08.0225.0
051.00.04.00.00.00.00.00.00.01.010.00.0125.00.0349.07.0
060.01.00.0125.01.00.00.00.03.00.02.0358.01.00.00.06.0
071.00.01.03.00.00.00.01.00.01.00.01.01.02.017.0469.0
080.00.00.02.01.00.00.02.00.00.00.018.02.01.0124.0347.0
091.01.01.00.00.00.00.01.0122.00.02.00.0308.04.041.016.0
101.0395.09.026.00.03.00.02.02.025.00.017.01.04.04.08.0
111.03.00.00.0181.060.05.0181.02.01.01.09.07.05.00.041.0
1234.050.028.079.02.020.01.046.00.00.01.05.07.039.020.0165.0
1320.02.06.015.064.01.02.042.029.00.02.019.099.05.016.0175.0
1461.019.0114.018.00.04.02.02.00.012.013.01.021.019.0145.066.0
1510.018.032.022.019.012.05.018.033.074.0113.054.013.026.020.028.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.854-0.386-0.254-0.537-0.5930.548-1.5940.146-0.8540.887-0.0340.322-1.2090.7470.0290.225
02-1.322-0.34-0.537-1.970.6191.099-1.3220.601-2.5780.451-0.034-1.016-1.4490.7010.322-0.296
030.199-0.484-0.932-1.5940.601-0.254-1.971.517-0.9320.25-0.9320.118-1.209-0.138-1.2090.471
04-2.578-4.395-2.2281.265-2.578-4.395-4.3951.237-4.395-4.395-4.3950.173-3.121-4.395-1.3221.969
05-3.121-4.395-1.97-4.395-4.395-4.395-4.395-4.395-4.395-3.121-1.108-4.3951.383-4.3952.408-1.449
06-4.395-3.121-4.3951.383-3.121-4.395-4.395-4.395-2.228-4.395-2.5782.433-3.121-4.395-4.395-1.594
07-3.121-4.395-3.121-2.228-4.395-4.395-4.395-3.121-4.395-3.121-4.395-3.121-3.121-2.578-0.5932.703
08-4.395-4.395-4.395-2.578-3.121-4.395-4.395-2.578-4.395-4.395-4.395-0.537-2.578-3.1211.3752.402
09-3.121-3.121-3.121-4.395-4.395-4.395-4.395-3.1211.359-4.395-2.578-4.3952.283-1.970.275-0.652
10-3.1212.531-1.209-0.176-4.395-2.228-4.395-2.578-2.578-0.214-4.395-0.593-3.121-1.97-1.97-1.322
11-3.121-2.228-4.395-4.3951.7520.652-1.7641.752-2.578-3.121-3.121-1.209-1.449-1.764-4.3950.275
120.0890.471-0.1020.926-2.578-0.433-3.1210.389-4.395-4.395-3.121-1.764-1.4490.225-0.4331.66
13-0.433-2.578-1.594-0.7150.717-3.121-2.5780.298-0.068-4.395-2.578-0.4841.151-1.764-0.6521.719
140.669-0.4841.291-0.537-4.395-1.97-2.578-2.578-4.395-0.932-0.854-3.121-0.386-0.4841.5310.747
15-1.108-0.5370.029-0.34-0.484-0.932-1.764-0.5370.060.8611.2820.548-0.854-0.176-0.433-0.102