Model info
Transcription factorKlf5
ModelKLF5_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length18
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusvvvvdGGGYGGGGMndSv
Best auROC (human)0.9601444961985297
Best auROC (mouse)0.988076729718824
Peak sets in benchmark (human)32
Peak sets in benchmark (mouse)23
Aligned words504
TF familyThree-zinc finger Krüppel-related factors{2.3.1}
TF subfamilyKrüppel-like factors{2.3.1.2}
MGI1338056
EntrezGene12224
UniProt IDKLF5_MOUSE
UniProt ACQ9Z0Z7
Comment
Downloads pcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 4.00131
0.0005 6.36691
0.0001 11.19621
GTEx tissue expression atlas Klf5 expression
ReMap ChIP-seq dataset list Klf5 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0119.014.051.07.036.029.040.012.064.050.099.018.06.09.037.07.0
0230.010.070.015.025.022.043.012.037.044.0127.019.05.010.022.07.0
0320.021.042.014.024.023.09.030.063.090.095.014.06.016.027.04.0
0439.01.064.09.049.08.054.039.060.011.034.068.014.01.040.07.0
054.00.0158.00.01.00.020.00.02.02.0187.01.02.01.0120.00.0
060.00.09.00.00.00.03.00.01.00.0481.03.00.00.01.00.0
070.00.01.00.00.00.00.00.02.02.0490.00.00.00.03.00.0
080.00.00.02.00.00.00.02.056.0311.00.0127.00.00.00.00.0
098.00.048.00.013.01.0292.05.00.00.00.00.03.00.0126.02.0
100.00.022.02.00.00.00.01.012.00.0332.0122.00.00.07.00.0
110.00.012.00.00.00.00.00.036.00.0320.05.02.03.0117.03.0
124.01.031.02.00.00.00.03.026.09.0396.018.02.00.06.00.0
135.023.02.02.01.06.02.01.040.0329.034.030.02.014.06.01.0
148.013.025.02.067.0143.074.088.05.025.06.08.08.014.010.02.0
1510.07.053.018.030.029.084.052.012.012.073.018.06.05.066.023.0
167.04.040.07.014.09.020.010.044.037.0173.022.08.024.073.06.0
1713.08.038.014.09.014.027.024.066.074.0139.027.07.07.029.02.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.486-0.7840.489-1.4510.144-0.070.248-0.9340.7150.4691.149-0.539-1.596-1.2110.171-1.451
02-0.036-1.110.804-0.717-0.216-0.3420.32-0.9340.1710.3431.397-0.486-1.766-1.11-0.342-1.451
03-0.435-0.3880.296-0.784-0.256-0.298-1.211-0.0360.6991.0541.108-0.784-1.596-0.654-0.14-1.971
040.223-3.1220.715-1.2110.449-1.3240.5460.2230.65-1.0180.0870.775-0.784-3.1220.248-1.451
05-1.971-4.3971.615-4.397-3.122-4.397-0.435-4.397-2.58-2.581.783-3.122-2.58-3.1221.34-4.397
06-4.397-4.397-1.211-4.397-4.397-4.397-2.23-4.397-3.122-4.3972.726-2.23-4.397-4.397-3.122-4.397
07-4.397-4.397-3.122-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-2.58-2.582.745-4.397-4.397-4.397-2.23-4.397
08-4.397-4.397-4.397-2.58-4.397-4.397-4.397-2.580.5822.291-4.3971.397-4.397-4.397-4.397-4.397
09-1.324-4.3970.429-4.397-0.856-3.1222.228-1.766-4.397-4.397-4.397-4.397-2.23-4.3971.389-2.58
10-4.397-4.397-0.342-2.58-4.397-4.397-4.397-3.122-0.934-4.3972.3561.357-4.397-4.397-1.451-4.397
11-4.397-4.397-0.934-4.397-4.397-4.397-4.397-4.3970.144-4.3972.319-1.766-2.58-2.231.315-2.23
12-1.971-3.122-0.004-2.58-4.397-4.397-4.397-2.23-0.177-1.2112.532-0.539-2.58-4.397-1.596-4.397
13-1.766-0.298-2.58-2.58-3.122-1.596-2.58-3.1220.2482.3470.087-0.036-2.58-0.784-1.596-3.122
14-1.324-0.856-0.216-2.580.761.5150.8591.031-1.766-0.216-1.596-1.324-1.324-0.784-1.11-2.58
15-1.11-1.4510.527-0.539-0.036-0.070.9850.508-0.934-0.9340.845-0.539-1.596-1.7660.745-0.298
16-1.451-1.9710.248-1.451-0.784-1.211-0.435-1.110.3430.1711.705-0.342-1.324-0.2560.845-1.596
17-0.856-1.3240.197-0.784-1.211-0.784-0.14-0.2560.7450.8591.487-0.14-1.451-1.451-0.07-2.58