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Model info
Transcription factorKlf5
ModelKLF5_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length18
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusvvvvdGGGYGGGGMndSv
Best auROC (human)0.96
Best auROC (mouse)0.988
Peak sets in benchmark (human)32
Peak sets in benchmark (mouse)23
Aligned words504
TF familyThree-zinc finger Krüppel-related factors {2.3.1}
TF subfamilyKrüppel-like factors {2.3.1.2}
MGIMGI:1338056
EntrezGeneGeneID:12224
(SSTAR profile)
UniProt IDKLF5_MOUSE
UniProt ACQ9Z0Z7
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 4.01511
0.0005 6.35816
0.0001 11.196010000000001
GTEx tissue expression atlas Klf5 expression
Motifs in JASPAR
MA0599.1 (KLF5; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0119.014.051.07.036.029.040.012.064.050.099.018.06.09.037.07.0
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0320.021.042.014.024.023.09.030.063.090.095.014.06.016.027.04.0
0439.01.064.09.049.08.054.039.060.011.034.068.014.01.040.07.0
054.00.0158.00.01.00.020.00.02.02.0187.01.02.01.0120.00.0
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100.00.022.02.00.00.00.01.012.00.0332.0122.00.00.07.00.0
110.00.012.00.00.00.00.00.036.00.0320.05.02.03.0117.03.0
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148.013.025.02.067.0143.074.088.05.025.06.08.08.014.010.02.0
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167.04.040.07.014.09.020.010.044.037.0173.022.08.024.073.06.0
1713.08.038.014.09.014.027.024.066.074.0139.027.07.07.029.02.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.486-0.7840.489-1.4510.144-0.070.248-0.9340.7150.4691.149-0.539-1.596-1.2110.171-1.451
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03-0.435-0.3880.296-0.784-0.256-0.298-1.211-0.0360.6991.0541.108-0.784-1.596-0.654-0.14-1.971
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06-4.397-4.397-1.211-4.397-4.397-4.397-2.23-4.397-3.122-4.3972.726-2.23-4.397-4.397-3.122-4.397
07-4.397-4.397-3.122-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-2.58-2.582.745-4.397-4.397-4.397-2.23-4.397
08-4.397-4.397-4.397-2.58-4.397-4.397-4.397-2.580.5822.291-4.3971.397-4.397-4.397-4.397-4.397
09-1.324-4.3970.429-4.397-0.856-3.1222.228-1.766-4.397-4.397-4.397-4.397-2.23-4.3971.389-2.58
10-4.397-4.397-0.342-2.58-4.397-4.397-4.397-3.122-0.934-4.3972.3561.357-4.397-4.397-1.451-4.397
11-4.397-4.397-0.934-4.397-4.397-4.397-4.397-4.3970.144-4.3972.319-1.766-2.58-2.231.315-2.23
12-1.971-3.122-0.004-2.58-4.397-4.397-4.397-2.23-0.177-1.2112.532-0.539-2.58-4.397-1.596-4.397
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