Model info
Transcription factorMef2c
ModelMEF2C_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length14
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusndhTATTTWWRdhh
Best auROC (human)0.94868413492135
Best auROC (mouse)0.9344675091850227
Peak sets in benchmark (human)6
Peak sets in benchmark (mouse)9
Aligned words499
TF familyRegulators of differentiation{5.1.1}
TF subfamilyMEF-2{5.1.1.1}
MGI99458
EntrezGene17260
UniProt IDMEF2C_MOUSE
UniProt ACQ8CFN5
Comment
Downloads pcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 10.46281
0.0005 12.36421
0.0001 16.22242
GTEx tissue expression atlas Mef2c expression
ReMap ChIP-seq dataset list Mef2c datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0118.05.043.078.07.07.015.034.019.016.046.047.07.022.039.095.0
029.029.08.05.08.031.02.09.019.079.015.030.031.0149.021.053.0
030.00.00.067.02.022.00.0264.02.01.00.043.01.02.00.094.0
044.01.00.00.021.02.01.01.00.00.00.00.0454.01.01.012.0
0521.02.04.0452.00.00.00.04.00.00.00.02.00.00.00.013.0
064.00.00.017.01.00.00.01.01.00.00.03.064.06.04.0397.0
078.03.01.058.00.00.00.06.00.00.00.04.03.029.00.0386.0
080.00.00.011.05.02.01.024.01.00.00.00.070.041.07.0336.0
0912.01.02.061.09.01.03.030.01.00.00.07.060.09.038.0264.0
1051.00.030.01.09.01.00.01.018.01.022.02.0262.03.095.02.0
1186.021.0183.050.01.03.00.01.021.013.080.033.02.00.02.02.0
1255.034.08.013.012.09.01.015.0105.099.020.041.025.032.011.018.0
1373.048.030.046.051.028.012.083.018.010.04.08.08.021.020.038.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.539-1.7660.320.911-1.451-1.451-0.7170.087-0.486-0.6540.3870.408-1.451-0.3420.2231.108
02-1.211-0.07-1.324-1.766-1.324-0.004-2.58-1.211-0.4860.924-0.717-0.036-0.0041.556-0.3880.527
03-4.397-4.397-4.3970.76-2.58-0.342-4.3972.127-2.58-3.122-4.3970.32-3.122-2.58-4.3971.097
04-1.971-3.122-4.397-4.397-0.388-2.58-3.122-3.122-4.397-4.397-4.397-4.3972.669-3.122-3.122-0.934
05-0.388-2.58-1.9712.664-4.397-4.397-4.397-1.971-4.397-4.397-4.397-2.58-4.397-4.397-4.397-0.856
06-1.971-4.397-4.397-0.595-3.122-4.397-4.397-3.122-3.122-4.397-4.397-2.230.715-1.596-1.9712.535
07-1.324-2.23-3.1220.617-4.397-4.397-4.397-1.596-4.397-4.397-4.397-1.971-2.23-0.07-4.3972.506
08-4.397-4.397-4.397-1.018-1.766-2.58-3.122-0.256-3.122-4.397-4.397-4.3970.8040.273-1.4512.368
09-0.934-3.122-2.580.667-1.211-3.122-2.23-0.036-3.122-4.397-4.397-1.4510.65-1.2110.1972.127
100.489-4.397-0.036-3.122-1.211-3.122-4.397-3.122-0.539-3.122-0.342-2.582.119-2.231.108-2.58
111.008-0.3881.7610.469-3.122-2.23-4.397-3.122-0.388-0.8560.9360.058-2.58-4.397-2.58-2.58
120.5640.087-1.324-0.856-0.934-1.211-3.122-0.7171.2071.149-0.4350.273-0.2160.027-1.018-0.539
130.8450.429-0.0360.3870.489-0.104-0.9340.973-0.539-1.11-1.971-1.324-1.324-0.388-0.4350.197