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Model info
Transcription factorMEF2D
(GeneCards)
ModelMEF2D_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length15
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnddYTATTTWTARhh
Best auROC (human)0.845
Best auROC (mouse)0.974
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)27
Aligned words498
TF familyRegulators of differentiation {5.1.1}
TF subfamilyMEF-2 {5.1.1.1}
HGNCHGNC:6997
EntrezGeneGeneID:4209
(SSTAR profile)
UniProt IDMEF2D_HUMAN
UniProt ACQ14814
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.28001
0.0005 11.400660000000002
0.0001 15.76581
GTEx tissue expression atlas MEF2D expression
ReMap ChIP-seq dataset list MEF2D datasets
Motifs in JASPAR
MA0773.1 (MEF2D; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0134.07.043.030.026.07.06.030.060.012.045.054.032.06.060.045.0
0211.08.088.045.03.05.011.013.011.09.079.055.015.015.059.070.0
031.030.05.04.03.028.00.06.06.0177.014.040.04.0145.08.026.0
040.01.00.013.00.05.00.0375.00.00.01.026.00.00.01.075.0
050.00.00.00.05.00.00.01.02.00.00.00.0476.00.02.011.0
0632.00.01.0450.00.00.00.00.00.01.00.01.01.00.00.011.0
0710.00.01.022.00.00.01.00.01.00.00.00.026.08.04.0424.0
080.00.00.037.00.00.01.07.00.00.00.06.042.015.03.0386.0
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109.01.02.0141.05.03.03.031.00.00.01.05.025.04.018.0249.0
1117.00.022.00.06.01.01.00.07.00.017.00.0346.00.076.04.0
1242.012.0297.025.01.00.00.00.04.05.090.017.00.01.01.02.0
1313.021.04.09.04.07.00.07.0124.0179.029.056.07.027.02.08.0
1458.029.022.039.063.069.05.097.012.010.04.09.021.031.015.013.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.089-1.4490.322-0.034-0.176-1.449-1.594-0.0340.652-0.9320.3670.5480.029-1.5940.6520.367
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04-4.395-3.121-4.395-0.854-4.395-1.764-4.3952.48-4.395-4.395-3.121-0.176-4.395-4.395-3.1210.874
05-4.395-4.395-4.395-4.395-1.764-4.395-4.395-3.121-2.578-4.395-4.395-4.3952.718-4.395-2.578-1.016
060.029-4.395-3.1212.662-4.395-4.395-4.395-4.395-4.395-3.121-4.395-3.121-3.121-4.395-4.395-1.016
07-1.108-4.395-3.121-0.34-4.395-4.395-3.121-4.395-3.121-4.395-4.395-4.395-0.176-1.322-1.972.602
08-4.395-4.395-4.3950.173-4.395-4.395-3.121-1.449-4.395-4.395-4.395-1.5940.298-0.715-2.2282.508
09-0.296-4.395-4.395-0.484-3.121-1.764-4.395-1.209-3.121-3.121-4.395-2.5781.4070.146-1.5942.137
10-1.209-3.121-2.5781.503-1.764-2.228-2.228-0.002-4.395-4.395-3.121-1.764-0.214-1.97-0.5372.071
11-0.593-4.395-0.34-4.395-1.594-3.121-3.121-4.395-1.449-4.395-0.593-4.3952.399-4.3950.887-1.97
120.298-0.9322.247-0.214-3.121-4.395-4.395-4.395-1.97-1.7641.056-0.593-4.395-3.121-3.121-2.578
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140.619-0.068-0.340.2250.7010.791-1.7641.13-0.932-1.108-1.97-1.209-0.386-0.002-0.715-0.854