Model info
Transcription factorMEF2D
ModelMEF2D_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length15
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnddYTATTTWTARhh
Best auROC (human)0.8452552441942092
Best auROC (mouse)0.9739477736479264
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)27
Aligned words498
TF familyRegulators of differentiation{5.1.1}
TF subfamilyMEF-2{5.1.1.1}
HGNC6997
EntrezGene4209
UniProt IDMEF2D_HUMAN
UniProt ACQ14814
Comment
Downloads pcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.26731
0.0005 11.40821
0.0001 15.76671
GTEx tissue expression atlas MEF2D expression
ReMap ChIP-seq dataset list MEF2D datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0134.07.043.030.026.07.06.030.060.012.045.054.032.06.060.045.0
0211.08.088.045.03.05.011.013.011.09.079.055.015.015.059.070.0
031.030.05.04.03.028.00.06.06.0177.014.040.04.0145.08.026.0
040.01.00.013.00.05.00.0375.00.00.01.026.00.00.01.075.0
050.00.00.00.05.00.00.01.02.00.00.00.0476.00.02.011.0
0632.00.01.0450.00.00.00.00.00.01.00.01.01.00.00.011.0
0710.00.01.022.00.00.01.00.01.00.00.00.026.08.04.0424.0
080.00.00.037.00.00.01.07.00.00.00.06.042.015.03.0386.0
0923.00.00.019.01.05.00.09.01.01.00.02.0128.036.06.0266.0
109.01.02.0141.05.03.03.031.00.00.01.05.025.04.018.0249.0
1117.00.022.00.06.01.01.00.07.00.017.00.0346.00.076.04.0
1242.012.0297.025.01.00.00.00.04.05.090.017.00.01.01.02.0
1313.021.04.09.04.07.00.07.0124.0179.029.056.07.027.02.08.0
1458.029.022.039.063.069.05.097.012.010.04.09.021.031.015.013.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.089-1.4490.322-0.034-0.176-1.449-1.594-0.0340.652-0.9320.3670.5480.029-1.5940.6520.367
02-1.016-1.3221.0330.367-2.228-1.764-1.016-0.854-1.016-1.2090.9260.566-0.715-0.7150.6360.806
03-3.121-0.034-1.764-1.97-2.228-0.102-4.395-1.594-1.5941.73-0.7820.25-1.971.531-1.322-0.176
04-4.395-3.121-4.395-0.854-4.395-1.764-4.3952.48-4.395-4.395-3.121-0.176-4.395-4.395-3.1210.874
05-4.395-4.395-4.395-4.395-1.764-4.395-4.395-3.121-2.578-4.395-4.395-4.3952.718-4.395-2.578-1.016
060.029-4.395-3.1212.662-4.395-4.395-4.395-4.395-4.395-3.121-4.395-3.121-3.121-4.395-4.395-1.016
07-1.108-4.395-3.121-0.34-4.395-4.395-3.121-4.395-3.121-4.395-4.395-4.395-0.176-1.322-1.972.602
08-4.395-4.395-4.3950.173-4.395-4.395-3.121-1.449-4.395-4.395-4.395-1.5940.298-0.715-2.2282.508
09-0.296-4.395-4.395-0.484-3.121-1.764-4.395-1.209-3.121-3.121-4.395-2.5781.4070.146-1.5942.137
10-1.209-3.121-2.5781.503-1.764-2.228-2.228-0.002-4.395-4.395-3.121-1.764-0.214-1.97-0.5372.071
11-0.593-4.395-0.34-4.395-1.594-3.121-3.121-4.395-1.449-4.395-0.593-4.3952.399-4.3950.887-1.97
120.298-0.9322.247-0.214-3.121-4.395-4.395-4.395-1.97-1.7641.056-0.593-4.395-3.121-3.121-2.578
13-0.854-0.386-1.97-1.209-1.97-1.449-4.395-1.4491.3751.741-0.0680.584-1.449-0.138-2.578-1.322
140.619-0.068-0.340.2250.7010.791-1.7641.13-0.932-1.108-1.97-1.209-0.386-0.002-0.715-0.854