Model info
Transcription factorMEIS1
ModelMEIS1_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length14
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusndTGAYTdATKdbn
Best auROC (human)0.8484531937078557
Best auROC (mouse)0.9523833472565219
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)37
Aligned words500
TF familyTALE-type homeo domain factors{3.1.4}
TF subfamilyMEIS{3.1.4.2}
HGNC7000
EntrezGene4211
UniProt IDMEIS1_HUMAN
UniProt ACO00470
Comment
Downloads pcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 10.80601
0.0005 12.55391
0.0001 15.98161
GTEx tissue expression atlas MEIS1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list MEIS1 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0146.017.055.05.058.011.09.032.078.07.023.021.046.012.040.038.0
0250.00.05.0173.05.00.00.042.016.00.04.0107.06.00.01.089.0
039.00.067.01.00.00.00.00.05.00.05.00.031.00.0373.07.0
0441.00.00.04.00.00.00.00.0444.01.00.00.06.01.01.00.0
0523.045.032.0391.00.00.00.02.00.00.00.01.00.00.00.04.0
063.00.03.017.021.00.02.022.03.01.01.027.041.03.029.0325.0
0734.02.013.019.01.01.00.02.09.01.018.07.054.015.083.0239.0
0896.01.01.00.017.01.01.00.0112.00.02.00.0245.08.014.00.0
0930.038.014.0388.05.00.01.04.00.02.00.016.00.00.00.00.0
103.01.021.010.014.01.08.017.01.00.04.010.045.010.0246.0107.0
1111.05.038.09.05.02.03.02.0109.016.090.064.036.010.068.030.0
1218.076.035.032.09.011.01.012.017.084.056.042.08.041.031.025.0
135.018.016.013.057.058.08.089.019.042.026.036.016.026.038.031.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.387-0.5950.564-1.7660.617-1.018-1.2110.0270.911-1.451-0.298-0.3880.387-0.9340.2480.197
020.469-4.397-1.7661.705-1.766-4.397-4.3970.296-0.654-4.397-1.9711.226-1.596-4.397-3.1221.043
03-1.211-4.3970.76-3.122-4.397-4.397-4.397-4.397-1.766-4.397-1.766-4.397-0.004-4.3972.472-1.451
040.273-4.397-4.397-1.971-4.397-4.397-4.397-4.3972.646-3.122-4.397-4.397-1.596-3.122-3.122-4.397
05-0.2980.3650.0272.519-4.397-4.397-4.397-2.58-4.397-4.397-4.397-3.122-4.397-4.397-4.397-1.971
06-2.23-4.397-2.23-0.595-0.388-4.397-2.58-0.342-2.23-3.122-3.122-0.140.273-2.23-0.072.335
070.087-2.58-0.856-0.486-3.122-3.122-4.397-2.58-1.211-3.122-0.539-1.4510.546-0.7170.9732.028
081.118-3.122-3.122-4.397-0.595-3.122-3.122-4.3971.272-4.397-2.58-4.3972.052-1.324-0.784-4.397
09-0.0360.197-0.7842.512-1.766-4.397-3.122-1.971-4.397-2.58-4.397-0.654-4.397-4.397-4.397-4.397
10-2.23-3.122-0.388-1.11-0.784-3.122-1.324-0.595-3.122-4.397-1.971-1.110.365-1.112.0571.226
11-1.018-1.7660.197-1.211-1.766-2.58-2.23-2.581.244-0.6541.0540.7150.144-1.110.775-0.036
12-0.5390.8850.1160.027-1.211-1.018-3.122-0.934-0.5950.9850.5820.296-1.3240.273-0.004-0.216
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