Model info
Transcription factorPOU2F1
ModelPO2F1_HUMAN.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length19
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusnbnYATGYAdATdhvnndn
Best auROC (human)0.8224787511270664
Best auROC (mouse)0.6874041255307352
Peak sets in benchmark (human)15
Peak sets in benchmark (mouse)14
Aligned words103
TF familyPOU domain factors{3.1.10}
TF subfamilyPOU2 (Oct-1/2-like factors){3.1.10.2}
HGNC9212
EntrezGene5451
UniProt IDPO2F1_HUMAN
UniProt ACP14859
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.44071
0.0005 11.23956
0.0001 15.02341
GTEx tissue expression atlas POU2F1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list POU2F1 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
018.02.010.02.00.017.05.01.03.06.018.04.01.09.08.08.0
026.01.01.04.017.03.07.07.013.010.014.04.05.05.01.04.0
031.023.02.015.03.02.02.012.01.08.00.014.00.05.03.011.0
043.00.02.00.027.01.01.09.05.01.00.01.048.00.02.02.0
051.01.02.079.00.00.00.02.00.00.02.03.01.01.00.010.0
060.02.00.00.01.00.01.00.00.00.04.00.09.01.083.01.0
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0952.00.022.021.00.00.00.00.00.00.00.00.04.00.01.02.0
1055.00.01.00.00.00.00.00.022.00.01.00.021.00.00.02.0
116.03.01.088.00.00.00.00.02.00.00.00.00.01.01.00.0
123.01.01.03.02.00.00.02.01.00.01.00.029.07.021.031.0
1312.03.03.017.04.03.00.01.017.04.00.02.09.016.01.010.0
148.03.031.00.017.05.02.02.01.03.00.00.05.06.08.011.0
154.01.012.014.011.02.02.02.06.09.021.05.07.03.02.01.0
163.012.04.09.05.05.04.01.04.016.03.014.06.01.05.010.0
179.00.03.06.026.01.04.03.06.01.08.01.02.011.012.09.0
1815.04.017.07.02.02.02.07.06.09.08.04.02.06.07.04.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.218-1.0690.434-1.069-3.1380.953-0.231-1.643-0.706-0.0581.01-0.441-1.6430.3320.2180.218
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04-0.706-3.138-1.069-3.1381.41-1.643-1.6430.332-0.231-1.643-3.138-1.6431.98-3.138-1.069-1.069
05-1.643-1.643-1.0692.476-3.138-3.138-3.138-1.069-3.138-3.138-1.069-0.706-1.643-1.643-3.1380.434
06-3.138-1.069-3.138-3.138-1.643-3.138-1.643-3.138-3.138-3.138-0.441-3.1380.332-1.6432.526-1.643
07-1.069-0.058-1.643-1.643-1.069-3.138-3.138-1.6430.092.327-3.1380.69-3.138-1.643-3.138-3.138
080.527-3.138-3.138-3.1382.327-3.138-3.1380.09-1.643-3.138-3.138-3.1380.83-3.138-3.138-3.138
092.06-3.1381.2071.161-3.138-3.138-3.138-3.138-3.138-3.138-3.138-3.138-0.441-3.138-1.643-1.069
102.116-3.138-1.643-3.138-3.138-3.138-3.138-3.1381.207-3.138-1.643-3.1381.161-3.138-3.138-1.069
11-0.058-0.706-1.6432.584-3.138-3.138-3.138-3.138-1.069-3.138-3.138-3.138-3.138-1.643-1.643-3.138
12-0.706-1.643-1.643-0.706-1.069-3.138-3.138-1.069-1.643-3.138-1.643-3.1381.480.091.1611.547
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