Model info
Transcription factorPou3f2
ModelPO3F2_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length19
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusbdnnbdYATGMATAWKYMW
Best auROC (human)0.7870168820065916
Best auROC (mouse)0.9563900579476947
Peak sets in benchmark (human)12
Peak sets in benchmark (mouse)22
Aligned words385
TF familyPOU domain factors{3.1.10}
TF subfamilyPOU3 (Oct-6-like factors){3.1.10.3}
MGI101895
EntrezGene18992
UniProt IDPO3F2_MOUSE
UniProt ACP31360
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.823860000000001
0.0005 9.92266
0.0001 14.384360000000001
GTEx tissue expression atlas Pou3f2 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0130.07.013.012.044.015.06.033.026.09.019.019.054.05.056.033.0
0243.034.020.057.015.011.01.09.026.020.015.033.025.019.023.030.0
0340.017.028.024.039.022.04.019.013.023.010.013.044.020.035.030.0
049.057.013.057.011.030.02.039.07.038.010.022.08.038.016.024.0
0515.08.04.08.061.07.05.090.011.09.05.016.059.019.031.033.0
0612.090.03.041.07.028.00.08.03.026.01.015.011.0115.02.019.0
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081.03.03.0348.00.00.00.07.00.00.00.00.00.02.02.015.0
091.00.00.00.03.00.02.00.01.02.02.00.085.06.0275.04.0
1043.045.01.01.02.05.00.01.0134.0134.02.09.02.02.00.00.0
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125.07.01.0353.00.01.00.05.01.00.00.01.00.01.01.05.0
134.00.00.02.08.01.00.00.01.01.00.00.0320.02.02.040.0
1458.017.05.0253.02.00.00.02.00.01.00.01.025.02.01.014.0
1512.01.02.070.08.01.01.010.00.00.03.03.014.05.0130.0121.0
165.018.01.010.01.06.00.00.02.0108.09.017.09.0113.048.034.0
179.07.01.00.0234.03.01.07.010.041.07.00.029.019.06.07.0
1843.07.015.0217.062.03.01.04.07.06.00.02.06.02.01.05.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.228-1.188-0.593-0.670.607-0.453-1.3340.3220.087-0.948-0.222-0.2220.81-1.5050.8460.322
020.5840.352-0.1720.864-0.453-0.755-2.87-0.9480.087-0.172-0.4530.3220.048-0.222-0.0340.228
030.512-0.3310.160.0080.487-0.078-1.711-0.222-0.593-0.034-0.847-0.5930.607-0.1720.380.228
04-0.9480.864-0.5930.864-0.7550.228-2.3220.487-1.1880.462-0.847-0.078-1.0610.462-0.390.008
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070.292-2.87-4.176-4.1762.321-1.97-4.176-0.847-1.334-4.176-4.176-4.1761.082-1.97-4.176-0.948
08-2.87-1.97-1.972.668-4.176-4.176-4.176-1.188-4.176-4.176-4.176-4.176-4.176-2.322-2.322-0.453
09-2.87-4.176-4.176-4.176-1.97-4.176-2.322-4.176-2.87-2.322-2.322-4.1761.261-1.3342.432-1.711
100.5840.629-2.87-2.87-2.322-1.505-4.176-2.871.7151.715-2.322-0.948-2.322-2.322-4.176-4.176
112.004-4.176-2.322-4.1761.998-1.711-4.176-1.711-2.87-2.87-4.176-2.87-1.061-2.87-4.176-2.322
12-1.505-1.188-2.872.682-4.176-2.87-4.176-1.505-2.87-4.176-4.176-2.87-4.176-2.87-2.87-1.505
13-1.711-4.176-4.176-2.322-1.061-2.87-4.176-4.176-2.87-2.87-4.176-4.1762.584-2.322-2.3220.512
140.881-0.331-1.5052.349-2.322-4.176-4.176-2.322-4.176-2.87-4.176-2.870.048-2.322-2.87-0.52
15-0.67-2.87-2.3221.068-1.061-2.87-2.87-0.847-4.176-4.176-1.97-1.97-0.52-1.5051.6851.613
16-1.505-0.275-2.87-0.847-2.87-1.334-4.176-4.176-2.3221.5-0.948-0.331-0.9481.5450.6930.352
17-0.948-1.188-2.87-4.1762.271-1.97-2.87-1.188-0.8470.537-1.188-4.1760.194-0.222-1.334-1.188
180.584-1.188-0.4532.1960.947-1.97-2.87-1.711-1.188-1.334-4.176-2.322-1.334-2.322-2.87-1.505