Model info
Transcription factorPrdm16
ModelPRD16_MOUSE.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length13
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusnKCCCWRRRGRvn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.876432016278956
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)3
Aligned words501
TF familyFactors with multiple dispersed zinc fingers{2.3.4}
TF subfamilyEvi-1-like factors{2.3.4.14}
MGI1917923
EntrezGene70673
UniProt IDPRD16_MOUSE
UniProt ACA2A935
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.819659999999999
0.0005 11.714770000000001
0.0001 15.478425
GTEx tissue expression atlas Prdm16 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0111.012.020.050.010.07.010.098.010.021.031.086.05.012.025.092.0
020.036.00.00.02.048.00.02.01.083.00.02.05.0317.04.00.0
031.06.00.01.04.0413.01.066.00.02.01.01.00.03.00.01.0
040.05.00.00.07.0411.03.03.00.02.00.00.00.068.00.01.0
054.00.00.03.0269.04.013.0200.02.00.00.01.00.00.00.04.0
0676.00.0176.023.00.00.04.00.01.00.012.00.022.06.0169.011.0
0714.07.077.01.02.00.01.03.045.033.0250.033.05.04.023.02.0
089.02.052.03.025.01.013.05.0164.010.0171.06.05.01.025.08.0
093.028.0170.02.02.03.09.00.04.022.0234.01.00.04.016.02.0
101.01.05.02.041.03.04.09.0289.016.0104.020.03.01.01.00.0
1152.0150.096.036.05.09.03.04.038.050.022.04.03.017.09.02.0
1227.017.028.026.067.081.013.065.040.028.028.034.07.010.019.010.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-1.022-0.938-0.4390.465-1.114-1.454-1.1141.135-1.114-0.392-0.0081.004-1.77-0.938-0.221.072
02-4.40.14-4.4-4.4-2.5840.425-4.4-2.584-3.1260.969-4.4-2.584-1.772.306-1.975-4.4
03-3.126-1.6-4.4-3.126-1.9752.57-3.1260.741-4.4-2.584-3.126-3.126-4.4-2.234-4.4-3.126
04-4.4-1.77-4.4-4.4-1.4542.565-2.234-2.234-4.4-2.584-4.4-4.4-4.40.771-4.4-3.126
05-1.975-4.4-4.4-2.2342.142-1.975-0.861.846-2.584-4.4-4.4-3.126-4.4-4.4-4.4-1.975
060.881-4.41.718-0.302-4.4-4.4-1.975-4.4-3.126-4.4-0.938-4.4-0.346-1.61.678-1.022
07-0.788-1.4540.894-3.126-2.584-4.4-3.126-2.2340.3610.0542.0690.054-1.77-1.975-0.302-2.584
08-1.215-2.5840.504-2.234-0.22-3.126-0.86-1.771.648-1.1141.69-1.6-1.77-3.126-0.22-1.328
09-2.234-0.1081.684-2.584-2.584-2.234-1.215-4.4-1.975-0.3462.003-3.126-4.4-1.975-0.658-2.584
10-3.126-3.126-1.77-2.5840.269-2.234-1.975-1.2152.213-0.6581.194-0.439-2.234-3.126-3.126-4.4
110.5041.5591.1140.14-1.77-1.215-2.234-1.9750.1930.465-0.346-1.975-2.234-0.599-1.215-2.584
12-0.144-0.599-0.108-0.1810.7560.945-0.860.7260.244-0.108-0.1080.083-1.454-1.114-0.49-1.114