Model info
Transcription factorSpib
ModelSPIB_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length19
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvRRWRRGGAASTGRdRvn
Best auROC (human)0.9988249567321642
Best auROC (mouse)0.9829657738900301
Peak sets in benchmark (human)12
Peak sets in benchmark (mouse)3
Aligned words500
TF familyEts-related factors{3.5.2}
TF subfamilySpi-like factors{3.5.2.5}
MGI892986
EntrezGene272382
UniProt IDSPIB_MOUSE
UniProt ACO35906
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.13476
0.0005 9.59966
0.0001 14.76881
GTEx tissue expression atlas Spib expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0180.015.088.08.033.019.021.018.060.023.037.08.022.018.035.013.0
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03257.012.042.015.016.03.03.05.038.013.017.07.019.07.018.026.0
04232.08.037.053.027.01.01.06.043.04.027.06.014.00.06.033.0
0551.018.0238.09.09.03.01.00.019.09.042.01.018.02.068.010.0
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122.03.00.036.010.02.00.071.022.08.00.0342.00.01.00.01.0
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16227.011.027.014.011.013.05.012.063.017.026.014.013.019.016.010.0
1749.0135.0114.016.021.019.05.015.017.019.017.021.013.016.013.08.0
1824.022.039.015.032.071.013.073.036.032.026.055.08.020.021.011.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.936-0.7171.031-1.3240.058-0.486-0.388-0.5390.65-0.2980.171-1.324-0.342-0.5390.116-0.856
021.487-1.5960.027-0.5390.273-1.324-1.451-0.4861.412-1.324-0.216-0.486-0.595-1.766-1.018-0.784
032.1-0.9340.296-0.717-0.654-2.23-2.23-1.7660.197-0.856-0.595-1.451-0.486-1.451-0.539-0.177
041.998-1.3240.1710.527-0.14-3.122-3.122-1.5960.32-1.971-0.14-1.596-0.784-4.397-1.5960.058
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08-3.122-4.3970.832-3.122-4.397-4.397-2.58-4.397-4.397-1.7662.581-4.397-3.122-4.397-4.397-4.397
09-2.58-4.397-4.397-4.397-1.971-4.397-4.397-3.1222.741-3.122-3.122-4.397-3.122-4.397-4.397-4.397
102.735-4.397-2.58-1.324-4.397-4.397-3.122-4.397-3.122-4.397-4.397-4.397-3.122-4.397-4.397-4.397
110.1440.9732.453-2.58-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-2.23-4.397-1.766-4.397-2.23-4.397
12-2.58-2.23-4.3970.144-1.11-2.58-4.3970.818-0.342-1.324-4.3972.386-4.397-3.122-4.397-3.122
13-2.58-2.58-0.036-4.397-3.122-2.23-1.211-3.122-4.397-4.397-4.397-4.397-1.971-0.4862.603-2.58
14-2.23-4.397-1.971-4.397-1.324-2.23-1.451-1.5962.3130.4290.898-0.388-3.122-4.397-2.58-4.397
152.007-0.9340.775-0.654-0.595-1.324-1.766-0.388-0.256-0.7840.171-0.717-1.971-1.451-1.11-1.596
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