Model info
Transcription factorTead2
ModelTEAD2_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length15
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnbRMATTCCWRSnhb
Best auROC (human)0.5508283293682106
Best auROC (mouse)0.9461410475720968
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)2
Aligned words309
TF familyTEF-1-related factors{3.6.1}
TF subfamilyTEF-4 (TEAD-2){3.6.1.0.3}
MGI104904
EntrezGene21677
UniProt IDTEAD2_MOUSE
UniProt ACP48301
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 8.63761
0.0005 10.82536
0.0001 15.472560000000001
GTEx tissue expression atlas Tead2 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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1417.010.029.062.019.036.05.025.012.012.012.013.04.010.018.024.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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041.038-2.67-2.118-4.0032.415-2.118-2.67-2.67-1.297-2.67-4.003-4.0030.085-4.003-4.003-4.003
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07-4.0030.175-2.67-4.003-4.003-4.003-4.003-4.003-4.003-2.118-4.003-4.003-4.0032.657-2.118-2.67
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