Model info
Transcription factorThap11
ModelTHA11_MOUSE.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusSCdnKGSMTbCTGGGAvdTGTAGTY
Best auROC (human)0.9499606739632185
Best auROC (mouse)0.7397591055474046
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)2
Aligned words107
TF familyTHAP-related factors{2.9.1}
TF subfamilyTHAP11 (HRIHFB2206){2.9.1.0.11}
MGI1930964
EntrezGene59016
UniProt IDTHA11_MOUSE
UniProt ACQ9JJD0
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
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0.0005 -2.12114
0.0001 4.02121
GTEx tissue expression atlas Thap11 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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