Model info
Transcription factorZic3
ModelZIC3_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length18
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnndShbhCCTGCTGdGhn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.9533388576764099
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)5
Aligned words226
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyGLI-like factors{2.3.3.1}
MGI106676
EntrezGene22773
UniProt IDZIC3_MOUSE
UniProt ACQ62521
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 6.43906
0.0005 8.641960000000001
0.0001 13.34121
GTEx tissue expression atlas Zic3 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
015.023.013.08.020.023.00.011.09.09.013.06.00.05.019.03.0
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033.08.017.03.010.07.03.05.07.020.042.02.02.05.033.00.0
041.014.04.03.013.016.02.09.018.052.010.015.01.04.04.01.0
052.023.06.02.04.031.05.046.06.06.03.05.00.014.010.04.0
063.06.01.02.014.030.04.026.00.09.02.013.015.021.09.012.0
070.032.00.00.00.065.01.00.00.016.00.00.00.053.00.00.0
080.00.00.00.011.0152.00.03.00.01.00.00.00.00.00.00.0
091.02.00.08.09.024.00.0120.00.00.00.00.00.02.00.01.0
100.01.09.00.04.02.020.02.00.00.00.00.03.09.0117.00.0
110.06.01.00.00.012.00.00.00.0135.011.00.00.02.00.00.0
120.00.00.00.04.01.02.0148.04.00.02.06.00.00.00.00.0
130.01.07.00.00.00.01.00.00.00.04.00.01.02.0151.00.0
141.00.00.00.01.00.00.02.053.07.031.072.00.00.00.00.0
150.02.052.01.01.01.03.02.00.02.028.01.00.03.065.06.0
160.01.00.00.03.01.00.04.061.038.023.026.02.03.00.05.0
1713.08.039.06.012.09.03.019.01.010.03.09.05.08.015.07.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.7040.7740.214-0.2570.6360.774-3.5150.051-0.143-0.1430.214-0.532-3.515-0.7040.586-1.176
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03-1.176-0.2570.476-1.176-0.042-0.385-1.176-0.704-0.3850.6361.37-1.534-1.534-0.7041.131-3.515
04-2.0980.286-0.912-1.1760.2140.417-1.534-0.1430.5321.582-0.0420.354-2.098-0.912-0.912-2.098
05-1.5340.774-0.532-1.534-0.9121.069-0.7041.46-0.532-0.532-1.176-0.704-3.5150.286-0.042-0.912
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08-3.515-3.515-3.515-3.5150.0512.65-3.515-1.176-3.515-2.098-3.515-3.515-3.515-3.515-3.515-3.515
09-2.098-1.534-3.515-0.257-0.1430.816-3.5152.415-3.515-3.515-3.515-3.515-3.515-1.534-3.515-2.098
10-3.515-2.098-0.143-3.515-0.912-1.5340.636-1.534-3.515-3.515-3.515-3.515-1.176-0.1432.389-3.515
11-3.515-0.532-2.098-3.515-3.5150.136-3.515-3.515-3.5152.5320.051-3.515-3.515-1.534-3.515-3.515
12-3.515-3.515-3.515-3.515-0.912-2.098-1.5342.624-0.912-3.515-1.534-0.532-3.515-3.515-3.515-3.515
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14-2.098-3.515-3.515-3.515-2.098-3.515-3.515-1.5341.601-0.3851.0691.906-3.515-3.515-3.515-3.515
15-3.515-1.5341.582-2.098-2.098-2.098-1.176-1.534-3.515-1.5340.968-2.098-3.515-1.1761.804-0.532
16-3.515-2.098-3.515-3.515-1.176-2.098-3.515-0.9121.7411.270.7740.895-1.534-1.176-3.515-0.704
170.214-0.2571.296-0.5320.136-0.143-1.1760.586-2.098-0.042-1.176-0.143-0.704-0.2570.354-0.385