Model info
Transcription factorZNF680
ModelZN680_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusTTGTCCYRYGWCCARGAAGAATR
Best auROC (human)0.9887694178642246
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words422
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyunclassified{2.3.3.0}
HGNC26897
EntrezGene340252
UniProt IDZN680_HUMAN
UniProt ACQ8NEM1
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -11.74894
0.0005 -8.353839999999998
0.0001 -0.93624
GTEx tissue expression atlas ZNF680 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF680 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.00.00.00.01.00.00.07.02.01.01.07.01.04.00.0397.0
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212.07.02.0366.01.00.00.07.00.00.01.02.00.02.00.032.0
220.00.03.00.06.01.00.02.01.00.02.00.062.08.0282.055.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-2.966-4.26-4.26-4.26-2.966-4.26-4.26-1.288-2.42-2.966-2.966-1.288-2.966-1.81-4.262.698
02-2.966-4.26-1.81-4.26-2.966-2.966-2.42-2.966-2.966-4.26-4.26-4.26-2.42-2.9662.723-2.966
03-2.966-4.26-2.966-2.069-4.26-4.26-4.26-2.42-4.26-1.288-2.9662.718-4.26-4.26-2.966-2.966
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06-4.26-4.26-4.26-4.26-0.4912.136-2.9661.125-4.26-2.42-2.966-4.26-4.261.16-1.288-2.42
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12-4.26-2.966-4.26-4.26-0.7712.639-4.26-0.375-4.26-2.966-4.26-4.26-2.966-0.621-2.966-4.26
13-0.947-2.966-2.42-4.262.665-2.42-1.81-4.26-2.966-4.26-4.26-4.26-0.855-4.26-1.434-2.966
142.113-2.0691.857-0.855-2.069-4.26-4.26-4.26-1.604-4.26-1.434-2.966-4.26-4.26-4.26-2.966
15-4.26-4.262.149-4.26-4.26-4.26-2.069-4.26-4.26-4.261.892-4.26-4.26-4.26-0.693-4.26
16-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.262.759-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26
172.673-4.260.251-2.966-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26
180.55-2.9662.532-1.81-4.26-4.26-4.26-4.26-1.81-4.26-0.014-1.81-4.26-4.26-2.966-4.26
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202.644-1.161-2.0690.251-2.966-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26-4.26
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