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Model info
Transcription factorZnf143
ModelZN143_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusSCRvdGSMYbMTGGGAvdYGTAGTY
Best auROC (human)0.999
Best auROC (mouse)0.992
Peak sets in benchmark (human)28
Peak sets in benchmark (mouse)9
Aligned words465
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF76-like factors {2.3.3.28}
MGIMGI:1277969
EntrezGeneGeneID:20841
(SSTAR profile)
UniProt IDZN143_MOUSE
UniProt ACO70230
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -5.4793400000000005
0.0005 -2.5558899999999998
0.0001 3.81691
GTEx tissue expression atlas Znf143 expression
Motifs in JASPAR
MA0088.1 (znf143; Xenopus laevis)
MA0088.2 (ZNF143; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.017.02.01.07.082.04.016.018.0270.08.018.01.014.01.04.0
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0343.026.064.09.012.02.010.08.050.055.0132.024.07.05.011.05.0
0420.05.055.032.021.02.036.029.061.014.086.056.03.01.021.021.0
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102.07.01.02.030.051.03.06.018.0164.05.06.07.0117.038.06.0
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17102.011.035.052.05.03.04.044.023.021.010.0111.04.00.03.035.0
180.020.06.0108.03.05.04.023.04.020.03.025.04.013.016.0209.0
192.00.09.00.05.01.051.01.03.03.023.00.05.01.0358.01.0
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2111.01.02.00.09.04.03.01.020.08.012.01.0367.00.022.02.0
220.03.0402.02.03.05.03.02.04.03.030.02.00.01.03.00.0
231.00.05.01.01.03.04.04.01.05.011.0421.02.01.01.02.0
243.00.00.02.01.01.02.05.03.09.06.03.07.0194.018.0209.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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12-4.336-4.336-1.9-4.336-4.336-4.3361.169-4.336-4.336-4.336-2.159-4.336-2.51-4.3362.509-4.336
13-4.336-4.336-2.51-4.336-4.336-4.336-4.336-4.336-3.054-4.3362.752-3.054-4.336-4.336-4.336-4.336
14-4.336-4.336-3.054-4.336-4.336-4.336-4.336-4.336-1.9-3.0542.741-2.51-4.336-4.336-3.054-4.336
15-1.9-4.336-4.336-4.336-3.054-4.336-4.336-4.3362.641-1.379-0.712-0.184-4.336-2.51-4.336-4.336
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23-3.054-4.336-1.695-3.054-3.054-2.159-1.9-1.9-3.054-1.695-0.9462.665-2.51-3.054-3.054-2.51
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